运输合同中造成货物损失挂靠公司要承担责任。
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以挂靠形式从事道路运输经营活动的机动车发生交通事故造成损害，属于该机动车一方责任，当事人请求由挂靠人和被挂靠人承担连带责任的，人民法院应予支持。
二、货物运输合同的性质如下：
1.合同主体的特殊性。
(1)承运人：提供运输服务，其基本条件是应当具备相应的运输工具；
(2)托运人：可以是货物的所有人，也可以是货物所有人委托的运输代理人或者货物保管人；
2.合同形式的特殊性。运输合同通常是标准合同，找法网提醒您，基本形式有托运单或者货物运单，当事人也可以通过签订具体的书面合同明确各自的权利、义务。
3.合同变更、解除条件的特殊性。托运人享有法定的单方的合同变更、解除权，但对变更、解除合同造成的损失及费用，应当予以赔偿。
4.运输合同的不得拒绝性。从事公共运输的承运人（指具有独占地位以及其提供的服务具有公用事业性质的承运人）不得拒绝托运人通常、合理的运输要求。
5.法律适用的特殊性。
三、签订货物运输合同要注意的有：
1.查看货运公司的真实性。在签订运输合同的时候，一定要对这家货运公司的真实性有所了解，查看一下它们的签章内容是否准确，如果遇到问题，还需要了解清楚，以免上当受骗。
2.查看合同的各项条款有无缺漏。
3.不要遗忘附加条款。
